荧光定量软件的ct值为什么会变
Ⅰ 最近做荧光定量PCR实验,浓度梯度之间的CT值相差还不到1,这是什么原因小弟初次做这实验,不太了解,请
CT值与浓度之间不是相差1的关系,而是一种线性关系。要根据你的CT 和浓度的关系来确定。
Ⅱ 荧光定量PCR检测时的CT值怎么确定的
高于背景荧光强度的值被确定为阈值。
CT值:C代表Cycle,T代表阈值(threshold),CT值的含义是:每个反应管内的荧光信号到达设定的阈值时所经历的循环数。控制在扩增曲线的指数增长阶段范围之内。阈值线与扩增曲线的交叉点确定CT值。具体见附图。
Ⅲ 做荧光定量时 扩增曲线和溶解曲线都很好 没有出现二聚体 但是为何目的基因的ct值大于30 ,在31左右。
朋友,首先跟你说一下我的经验,其实这里有个误区,其实普通PCR对Realtime
PCR的指导意义实在是太小,因为realtime
PCR的引物跟普通PCR的引物有很大差别,realtime
PCR的引物因为要顾及试验体系的要求,所以在引物性能方面有一些牺牲,比如有时候要求180-200bp的扩增需要会牺牲一些性能,比如存在二聚体之类的东西。溶解曲线没有明显的峰说明没有扩增产物,这里面问题很多,比如温度条件、引物条件等等,最好还是能够找公司帮你设计引物,比如takara等公司,可以帮你设计引物。再有一个问题,你说你的模板稀释倍数越来越小依然没有产物,你觉得困扰,其实并不是像你想的那样,按照你的思路,你扩增产物应该是丰度比较低的产物,这样的扩增反应你认为模板量越大越好,其实不然,因为反转录buffer和realtime
buffer是不同的,而且反转录体系的一些组分能够抑制realtime反应的进行,因此,可能你稀释倍数越低,最后反而realtime反应的扩增效率越低,你可以尝试把稀释倍数高一些试试看,因为当时我在做实验的时候确实在丁香园上看到有的战友提到过这样的问题,如果再有问题我们可以再讨论,大家一起提高,希望能帮到你。
如果回答对您有用,请及时采纳。
Ⅳ 荧光定量PCR的CT过小是为什么啊,不是说基准线是3到15个循环,出现在这个基准线的ct原因是什么啊
这是因为DNA复制量未达到仪器检测到的水平,但实际PCR循环却真实进行,反映在仪器曲线上为基线,直到量变达到质变时,才会被仪器检测到,变成指数增长期
Ⅳ 实时荧光定量PCR CT值偏大的原因是什么
CT值偏大是因为扩增产物量低引起的,而后者的原因很多,比如底物浓度低,引物效率低,有抑制反应的物质存在等等。
Ⅵ 荧光定量pcr中关于阈值的设置是否会影响Ct值
阈值和基线的设置肯定会影响Ct值,你可以采用每次反应完后软件自己选定的阈值。你也可以手动调整,但是如果你是相同的模板,做不同反应,那你必须使两次实验的阈值和基线调到相同。使用相同的标准品,才能减小不同批次反应的误差。
Ⅶ 荧光实时定量做标准曲线时,有两个浓度的CT值一样,为什么会这样如何改进
您可以使用2-ΔΔCT法的相对量,绝对定量标准曲线。
Ⅷ 求助关于荧光定量PCR的CT值问题
如果有标准曲线,按照标准曲线计算。
一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下:
对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。
首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是对照组的2倍。
基因A: delta CT=20-18=2。2的2次方是4。也就是说基因A的量在实验组是对照组的4倍。但是由于加样量是2倍,所以4处以2=2,最后的相对量是2倍。
几点注意:
1。必须确定扩增的特异性
2。 只有相同目标的CT值才能相减(扩增效率有可能不同)
3。 2的某次方只是理论值,实际扩增效率低于2。
4。 最好不用Syber Green
Ⅸ 荧光定量的Ct值和Cp值的区别在哪里
正常啊,定量PCR很灵敏的,体系稍微变化就会误差很大,更何况你这样反应体系都不一样。所以一般定量结果只是作为佐证,最好别太相信。你想做好,就尽量保证每个体系是一致的,最后结果趋势是一致的就行了。
Ⅹ 请问:做荧光定量PCR时,△△Ct值是什么意思,它的计算公式是什么
△△Ct是荧光定量计算公式的简化形式,用于比较不同样品之间的差别或变化比率。
Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX₀+lgN/lg(1+Ex),其中,n为扩增反应的循环次数,X₀为初始模板量,Ex为扩增效率,N为荧光扩增信号达到阈值强度时扩增产物的量。△Ct(n)=Ct(目的基因)-Ct(内参基因);△△CT(n)=△Ct(n)-△Ct(1)。
起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。
(10)荧光定量软件的ct值为什么会变扩展阅读
荧光定量PCR的原理:
荧光定量PCR技术:在PCR反应体系中加入荧光基团,通过荧光信号不断累积而实现实时监测PCR全程,然后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在实时荧光定量PCR中,对全程PCR扩增过程进行实时检测,根据反应时间和荧光信号的变化可以绘制成一条曲线。
实时荧光定量常用的荧光化学分类有SYBR Green I法和Tag Man探针法。
Ct值:C代表Cycle,t代表threshold,Ct值的含义是每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。